一天，他走过一个学馆门口，看见学馆里的教师，拿着一支笔，正在画画。他不自觉地走了进去，对教师说： “我很想学画，借给我一支笔可以吗?”
教师瞪了他一眼，“呸!”一口唾沫啐在他脸上，骂道：“穷娃子想拿笔，还想学画?做梦啦!”说完，就将他撵出大门来。
马良是个有志气的孩子，他说：“偏不相信，怎么穷孩子连画也不能学了!”从此，他下决心学画，每天用心苦练。
他到山上打柴时，就折一根树枝，在沙地上学着描飞鸟。他到河边割草时，就用草根蘸蘸河水，在岸石上学着描游鱼。晚上，回到家里，拿了一块木炭，在窑洞的壁上，又把白天描过的东西，一件一件再画一遍。没有笔，他照样学画画。
一年一年地过去，马良学画从没有一天间断过。他的窑洞四壁，画上叠画，麻麻花花全是画了。当然，进步也很快，真是画起的鸟就差不会叫了，画起的鱼就差不会游了。
一回，他在村口画了只小母鸡，村口的上空就成天有老鹰打转。一回，他在山后画了只黑毛狼，吓得牛羊不敢在山后吃草。但是马良还没有一支笔啊!他想，自己能有一支笔该多么好呢!
有一个晚上，马良躺在窑洞里，因为他整天地干活、学画，已经很疲倦，一躺下来，就迷迷糊糊地睡着了。不知道什么时候，窑洞里亮起了一阵五彩的光芒，来了个白胡子的老人，把一支笔送给他：“这是一支神笔，要好好用它!”
马良接过来一看，那笔金光灿灿的;拿在手上，沉甸甸的。他喜得蹦起来： “谢谢你，老爷爷，……”马良的话没有说完，白胡子老人已经不见了。
马良一惊，就醒过来，揉揉眼睛，原来是个梦呢!可又不是梦啊!那支笔不是很好地在自己的手里吗!
他十分高兴，就奔了出来，挨家挨户去敲门，把伙伴都叫醒，告诉他们：“我有支笔啦!”这时才半夜哩! 他用笔画了一只鸟，鸟扑扑翅膀，飞到天上去，对他喊喊喳喳地唱起歌来。他用笔画了一条鱼，鱼弯弯尾巴，游进水里去，对他一摇一摆地跳起舞来。他乐极了，说：“这神笔，多好呀!”
马良有了这支神笔，天天替村里的穷人画画：谁家没有犁耙，他就给他画犁耙;谁家没有耕牛，他就给他画耕牛;谁家没有水车，他就给他画水车;谁家没有石磨，他就给他画石磨……
天下没有不透风的墙，消息很快地传进了邻近村里一个大财主的耳朵。这财主，就派两个家丁来把他抓去，逼他画画。
马良年纪虽小，却生来是个硬性子。他看透有钱人的坏心肠，任凭财主怎样哄他、吓他，要他画个金元宝，他就是不肯画。
财主就把他关在一间马厩里，也不给他饭吃。 傍晚，雪纷纷扬扬地落着，地上已经积起了厚厚一层。财主想，马良这一下不是饿死，也准冻死了。他走过马厩门口，只见门缝里透出红红的亮光，还闻到一股香喷喷的味道。他觉得奇怪，凑近眼去，往门缝里一张，啊!马良不但没有死，而且还烧起了一个大火炉，一面烤着火，一面正吃着热烘烘的饼子呢!财主知道，这火炉和饼子，一定是马良用神笔画的，就气呼呼地去叫家丁来，要他们把马良杀死，夺下那支神笔。
十多个凶猛的家丁，冲进了马厩，却不见马良，只见东面墙壁上，靠着一架梯子。马良趁着天黑，攀上这梯子，翻墙走了。财主急忙攀上梯子去追，没爬上三步，就摔下来了。原来，这梯是马良用神笔画的。
马良出了财主的家，他知道在村里是不能住了，他向自己的村庄挥了挥手，默默地说了一句：“伙伴们，再见啦!”马良用神笔画了一匹大骏马，跳上马背，向大路上奔去。
没有走出多少路，只听见后面一阵喧哗，回头一看，火把照得通明，财主骑着匹快马，手执一把明晃晃的钢刀，带着一二十个家丁，追上来了。眼看就要追着了，马良不慌不忙，用神笔画了一张弓，一支箭。箭一上弦，“飕”的一声，正射中财主的咽喉，财主翻身跌下马去了。
马良拍拍大骏马，大骏马像飞一样地向前驰去了。 马良连日带夜地在路上跑了几天，到了一个市镇里，看看离家乡已经很远，就在这儿住下来。
他画了许多画，拿到街坊去卖。因为他怕别人知道，便不让画活起来，画成的东西，不是少嘴便是断腿的。
一天，他画了一只没有眼睛的白鹤。一不小心，在它脸上溅上一滴墨水，白鹤便眼睛一睁，扇扇翅膀飞上天去了。
这一来，整个市镇都轰动了。当地的官员，马上把这件事奏给了皇帝。皇帝就下了一道圣旨，派人来召他到京都去。马良不肯去，他们把他拉去了。
马良听见过许多皇帝欺侮穷人的事，心里恨透了，哪肯给皇帝画画呢!皇帝叫他画一条龙，他却画了一只大壁虎;皇帝叫他画一只凤，他却画了一只大乌鸦。大壁虎和大乌鸦十分难看，在金銮殿里乱爬乱叫，还打起架来，弄得宫殿里乌七八糟。
皇帝大为发怒，就命卫士们抢下他的神笔，把他打入了天牢。 皇帝拿到神笔，就自己来画了。他先画了一座金山。贪心不足的皇帝，画了一座又一座，画了一座又一座，重重叠叠地画了许多。画好一看，哪是金山!却是一堆堆的大石头;上面压得太多，就塌下来，差一点把皇帝的脚也打伤。
皇帝还不死心。他心里想，画金山不成，就换金砖。他画了一块嫌小，画了一块嫌小，最后画了长长的一大条。画好一看，哪是金砖!却是一条长长的大蟒蛇，张开血盆似的大口，向他扑来。幸亏卫士们救得快，不然，皇帝早被大蟒蛇吃掉了。
皇帝没有办法，只得把马良放出来，又假惺惺地对他说了一些好话，说什么要给他许多许多金银，还说什么要把公主嫁给他，招他做驸马。 马良一心想夺回神笔，他装作答应下来。皇帝见马良答应了，十分高兴，就把神笔还给了马良，要马良给他画画。
皇帝想，画金山、金砖都不成，那么画株摇钱树吧!摇钱树上，长的都是钱，轻轻一摇，就能掉下许多钱来，这有多好啊!他就叫马良画摇钱树了。
马良心里打定了主意，不说什么话，提起神笔一挥，一个无边的大海，出现在眼前了。蓝蓝的海水，没有一丝波纹，亮闪闪的像一面大玉镜。
皇帝看了很不高兴，脸一板，骂道：“叫你画摇钱树，谁叫你画海!”马良在大海中央画了块小岛，岛上画了株又高又大的树，说：“这不是摇钱树吗?”
皇帝看见那株树，发着耀眼的金色光芒，喉咙里咽了几口唾水，就嘻嘻地笑了起来，急巴巴地对马良说：“赶快画只船吧!我要到海中央去摇钱!”
马良画了一只很大很大的木船，皇帝就带了娘娘、太子、公主和许多大臣、将军，都上船去了。马良又画了几笔风，海水掀起密密的波纹，大木船就开动了。
皇帝心里痒滋滋的，嫌船走得太慢，在船头上叫：“风大些!风大些!……”马良就加了几笔粗粗的风。海动荡起来了，白帆鼓得满满的，木船急速地向海中央驶去。
马良又加上几笔大风。大海不安地吼叫起来，卷起滚滚的浪涛，大木船摇摇晃晃了。皇帝心里害怕，向马良摇手，大声地喊道：“风够了!风够了!……”
马良装作没有听见，不歇手地画着风。海水发怒了，浪涛扑上船去了。船倾斜了，船上乱起来了。皇帝被海水打得浑身湿漉漉的，抱着船的桅杆，不住地叫喊：“风太大了!船要翻了!不要再画了!……”马良不去睬他，还是不住手地画风。
风更大了，吹来了许多厚厚的乌云，又鸣雷，又闪电，还下起暴雨来。浪更猛了，海水像一堵堵倒坍的高墙，接连不断地往船上压去。 船翻了，船碎了，皇帝他们都沉到海底去了。皇帝死了以后，《神笔马良》的故事就传开了。但是，马良后来到什么地方去了呢，大家都不清楚。 有的说：他回到自己的家乡，和那些种地的伙伴在一起。 有的说：他到处流浪，专门给许多穷苦的人们画画..............